醫院污水處理是指處理醫院排放的污水的處理方式。醫院的污水，除一般生活污水外，還含有化學(xué)物質(zhì)、放射性廢水和病原體。因此，經(jīng)過(guò)處理后才能排放，特別是肝炎等傳染病病房排出來(lái)的污水，須經(jīng)消毒后才可排放。無(wú)集中式污水處理設備的醫院，對有傳染性的糞便，單消毒使其無(wú)害化。常用消毒劑有二氧化氯、漂白粉、液氯、次氯酸鈉、臭氧。對含放射性同位素的污水，應按同位素處理要求處理。醫院污水在處理過(guò)程中，沉淀的污泥含有大量的細菌、病毒和寄生蟲(chóng)卵，須經(jīng)消毒（常用熟石灰消毒）或高溫堆肥后方可用作肥料。

醫院各部門(mén)的功能、設施和人員組成情況不同，產(chǎn)生污水的主要部門(mén)和設施有：診療室、化驗室、病房、洗衣房、X光照像洗印、動(dòng)物房、同位素治療診斷、手術(shù)室等排水。醫院行政管理和醫務(wù)人員排放的生活污水，食堂、單身宿舍、家屬宿舍排水。不同部門(mén)科室產(chǎn)生的污水成分和水量各不相同，如重金屬廢水、含油廢水、洗印廢水、放射性廢水等。而且不同性質(zhì)醫院產(chǎn)生的污水也有很大不同。醫院污水較一般生活污水排放情況復雜。

醫用污水處理的原則是：分質(zhì)分流，局部分隔治理，把污染就近消滅在污染源。主要處理方法為沉淀與消毒。我國常用的消毒劑為液氯，近年來(lái)，為了提高消毒效率及不產(chǎn)生二次污染多趨向采用臭氧化法消毒，消毒處理后均可達到排放標準。處理過(guò)程中產(chǎn)生的污泥常采用石灰消毒法及高溫堆肥法進(jìn)行處理。
對于綜合醫院(不帶傳染病房)污水處理可采用“預處理→強化處理→消毒”的工藝。通過(guò)混凝沉淀(過(guò)濾)去除攜帶病毒、病菌的顆粒物，提高消毒效果并降低消毒劑的用量，從而避免消毒劑用量過(guò)大對環(huán)境產(chǎn)生的不良影響。 醫用污水處理的強化處理一般采用混凝沉淀、過(guò)濾、氣浮等工藝。過(guò)濾的固液分離方式需要反沖，操作管理較為復雜，而氣浮工藝中氣體釋放易導致二次污染。所以醫用污水中一般采用混凝沉淀工藝。
傳染病醫院的污水和糞便宜分別收集。生活污水直接進(jìn)入預消毒池進(jìn)行消毒處理后進(jìn)入調節池，病人的糞便應先立消毒后，通過(guò)下水道進(jìn)入化糞池或單處理（如虛線(xiàn)所示）。各構筑物須在密閉的環(huán)境中運行，通過(guò)統一的通風(fēng)系統進(jìn)行換氣，廢氣通過(guò)消毒后排放，消毒可采用紫外線(xiàn)消毒系統 好氧生化處理單元去除CODcr、BOD5等有機污染物，好氧生化處理可選擇接觸氧化、活性污泥和好氧處理工藝，如膜生物反應器、曝氣生物濾池等工藝。采用具有過(guò)濾功能的好氧處理工藝，可以降低懸浮物濃度，有利于后續消毒。 適用于傳染病醫院(包括帶傳染病房的綜合醫院)和排入自然水體的綜合醫院處理。
簡(jiǎn)易生化處理工藝的流程為“沼氣凈化池→消毒”。沼氣凈化池分為固液分離區、厭氧濾池和沉淀過(guò)濾區。三區的主要功能分別為去除懸浮固體，吸附膠體和溶解性物質(zhì)，進(jìn)一步去除和降解有機污染物，后通過(guò)沉淀和過(guò)濾單元去除剩余懸浮物和降解有機污染物，出水質(zhì)量。所產(chǎn)生沼氣根據氣量大小作不同的處理，當1m3污泥制取沼氣達15m3以上時(shí)，收集利用；當1m3污泥制取沼氣不足15m3時(shí)，收集燃燒處理。 沼氣凈化池利用厭氧消化原理進(jìn)行固體有機物降解。沼氣凈化池的處理效率優(yōu)于腐化池和沼氣池，造價(jià)低、動(dòng)力消耗低，管理簡(jiǎn)單。 作為對于邊遠山區、經(jīng)濟欠發(fā)達地區醫用處理的過(guò)渡措施，逐步實(shí)現二級處理或加強處理效果的處理。