醫院各部門(mén)的功能、設施和人員組成情況不同，產(chǎn)生污水的主要部門(mén)和設施有：診療室、化驗室、病房、洗衣房、X光照像洗印、動(dòng)物房、同位素治療診斷、手術(shù)室等排水。醫院行政管理和醫務(wù)人員排放的生活污水，食堂、單身宿舍、家屬宿舍排水。不同部門(mén)科室產(chǎn)生的污水成分和水量各不相同，如重金屬廢水、含油廢水、洗印廢水、放射性廢水等。而且不同性質(zhì)醫院產(chǎn)生的污水也有很大不同。醫院污水較一般生活污水排放情況復雜。

醫院排出的放射性廢水常用貯存衰減法處理。醫院常用的放射性同位素如131碘,32磷,198金，24鈉等是半衰期較短的同位素，因此可以將放射性污水貯存于地下衰變水池內,貯存時(shí)間為10倍于半衰期,把放射性濃度降到容許排放的程度。如果放射性污水的濃度很低，水量很小，也可用稀釋法處理。中國的《放射性防護規定》要求每一微居里放射性同位素達到容許排放濃度需稀釋水量1.67米3。當放射性污水濃度很高,放射性的半衰期很長(cháng)，不宜用貯存法和稀釋法處理時(shí)，可用蒸發(fā)法、離子交換法或凝聚沉淀法進(jìn)行分離濃縮處理（見(jiàn)放射性廢水處理）。

醫院污水處理過(guò)程中排出的污泥按每張病床計，每天平均為0.7～1升，含水95%，含有污水中病原體總量的70～80%，進(jìn)行消毒處理。消毒方法有加熱消毒、化學(xué)藥劑消毒、γ射線(xiàn)消毒等。加熱消毒的熱源通常為蒸汽、電能或生物能（高溫堆肥），有的地區可以用太陽(yáng)能?；蛘哂梅贌ㄌ幚恚ㄒ?jiàn)污泥焚燒）?；瘜W(xué)藥劑消毒可用漂白粉、石灰、氨水、液氯或苛性鈉等。用漂白粉或液氯時(shí),有效氯用量約為污泥量的2.5%。用堿性藥劑時(shí)，污泥的pH值達到12后，保持半小時(shí)以上，效果好。γ射線(xiàn)消毒可用60鈷或一些裂變產(chǎn)物的混合物作輻射源，輻射劑量為20～30萬(wàn)倫琴。用此法對污泥消毒不產(chǎn)生臭氣，并可改善污泥的脫水和沉降性，但費用較高。

傳染病醫院的污水和糞便宜分別收集。生活污水直接進(jìn)入預消毒池進(jìn)行消毒處理后進(jìn)入調節池，病人的糞便應先立消毒后，通過(guò)下水道進(jìn)入化糞池或單處理（如虛線(xiàn)所示）。各構筑物須在密閉的環(huán)境中運行，通過(guò)統一的通風(fēng)系統進(jìn)行換氣，廢氣通過(guò)消毒后排放，消毒可采用紫外線(xiàn)消毒系統 好氧生化處理單元去除CODcr、BOD5等有機污染物，好氧生化處理可選擇接觸氧化、活性污泥和好氧處理工藝，如膜生物反應器、曝氣生物濾池等工藝。采用具有過(guò)濾功能的好氧處理工藝，可以降低懸浮物濃度，有利于后續消毒。 適用于傳染病醫院(包括帶傳染病房的綜合醫院)和排入自然水體的綜合醫院處理。
根據國家環(huán)?？偩值挠嘘P(guān)規定（國家環(huán)?？偩?醫院污水處理技術(shù)指南.2003.12（環(huán)發(fā)（2003）197號 ），將各類(lèi)醫院按性質(zhì)分為綜合醫院和傳染病醫院兩類(lèi)，與衛生系統對醫院及醫療機構的劃分方法有差別。其中傳染病醫院指傳染性疾病專(zhuān)科醫院和帶傳染病房的綜合醫院，綜合醫院為不帶傳染病房的綜合醫院和各類(lèi)非傳染性疾病的專(zhuān)科醫院。醫院污水凈化包括綜合醫院、中醫醫院、中西醫結合醫院、民族醫院和專(zhuān)科醫院（傳染病醫院（包括結核病院）、心血管病醫院、腫瘤醫院、口腔醫院、婦產(chǎn)科醫院和精神病醫院等等）各類(lèi)醫院污水的處理，同時(shí)也包括療養院、康復醫院等其它醫療機構和獸醫院的污水處理工程。
根據醫院的規模、性質(zhì)和處理污水排放去向，進(jìn)行工藝選擇。主要采用的工藝有三種：加強處理效果的處理、二級處理和簡(jiǎn)易生化處理。醫院污水處理一般采取工程設計、建設及驗收的操作與管理辦法，其處理設施需經(jīng)過(guò)一定時(shí)間的試運行，處理效果才能達到預期目的?；瘜W(xué)法治理需經(jīng)一個(gè)月的試運行，二級生化法處理需經(jīng)三個(gè)月以上的試運行。因此，小型綜合醫院（主要包括城市衛生服務(wù)社區、鄉鎮衛生院）亟需尋求一種資金投入較少、建設周期較短、安全穩妥達標的技術(shù)方案（設備）。